استنكر حقوقيون وناشطون، قرار نيابة الاستئناف بمحافظة شبوة، تحويل قضية الشيخ اغتيال عبدالله الباني إلى محكمة العسكرية، معتبرين هذه الخطوة انحيازا واضحا للمجرمين بداية لتصفية القضية.